La Struttura Semplice " Virologia Specialistica" contempla, tra i propri compiti prioritari, alcune attività in ambito prettamente istituzionale; in particolare, cura lo svolgimento di Piani nazionali di sorveglianza e monitoraggio nei riguardi di alcune infezioni virali emergenti e riemergenti, piani predisposti dal Ministero della Salute.